TF information

TF name: ZNF423
TF family: zf-C2H2
Ensembl gene ID: ENSG00000102935
Ensembl protein ID: ENSP00000455426, ENSP00000455061, ENSP00000455588, ENSP00000457928, ENSP00000262383, ENSP00000457664, ENSP00000442321
Entrez gene ID: 23090
Database name Link Database name Link
NCBI Gene: Genecards:
Uniprot: Wikipedia:
Cosmic 3D: Geneontology:
CCLE:

Frequency of ZNF423 in all biosamples
Sample ID Biosample type Tissue type Biosample name TF Frequency
Sample_02_310Cell lineNeuroblastomaSJNB80.048492791612058
Sample_02_318Cell lineNeuroblastomaNB690.0625

ZNF423 distribution in samples’ most representative CRC
Sample ID Tissue type Biosample type Biosample name

ZNF423 distribution in all CRCs
Biosample type
Biosample name
Sample ID

Genomic distribution of SEs associated with ZNF423
Download

Mutation of ZNF423
Database name Link
gnomAD: gnomAD
ExAC: ExAC
ICGC:
Database name Link
Cosmic:
Cosmic cell lines:
Depmap:

TCGA somatic mutations and clinical variants of ZNF423

rsID Chr Start Stop Ref Alt Gene_region Gene_symble Effect TCGA_Occurrence
-chr164967086749670867CGexonicZNF423nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
-chr164967000149670001CTexonicZNF423nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRC|1|451|0.00222
-chr164967171349671713CTexonicZNF423nonsynonymous CESC|1|194|0.00515
-chr164967095849670958GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164976487049764870CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|2|368|0.00543
rs550048605chr164967259549672595GAexonicZNF423synonymous UCEC|1|248|0.00403
rs372366526chr164966972749669727GAexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164966981649669816CGexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967102049671020CTexonicZNF423synonymous LIHC|1|373|0.00268
rs375001883chr164967187049671870CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967163049671630GAexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
rs756709776chr164976485349764853GCexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
rs138278000chr164967087649670876GAexonicZNF423synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967186949671869CTexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164966011249660112CGexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164976470849764708TGexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967006249670062CTexonicZNF423nonsynonymous HNSC|2|512|0.00391
-chr164967002549670025AGexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967129449671294TCexonicZNF423nonsynonymous LUAD|2|543|0.00368
-chr164967228149672281TCexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967237549672375CAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
rs149531360chr164976475149764751CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967174649671746CTexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164985656849856581CTCCCCTGCTCACC-exonicZNF423frameshift LUAD|1|543|0.00184
-chr164967040449670404CAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164966963549669635TAexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
rs376264701chr164967042349670423GAexonicZNF423synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967224749672247GAexonicZNF423synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164966979449669794CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967006049670060CGexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs150555141chr164967099949670999CTexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967183649671836AGexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967269049672690G-exonicZNF423frameshift KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
-chr164967023149670231CAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
rs377052758chr164967272549672725GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164966016249660162TCexonicZNF423nonsynonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr164967035049670350GTexonicZNF423synonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr164955937549559375CTexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967138049671380CGexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164982343949823439GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|2|368|0.00543
-chr164967149949671499AGexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967151349671513AGexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164966985349669853GCexonicZNF423synonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164967039149670391CTexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
rs777432098chr164967034949670349CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967046149670461CTexonicZNF423nonsynonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820
-chr164967168749671687TCexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967114849671148GAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967172149671721CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967187149671871GTexonicZNF423synonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967188849671888CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs143285873chr164967081149670811CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204,ESCA|1|185|0.00541
-chr164967205349672053CAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164976475149764751CAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164967120349671203GTexonicZNF423synonymous TGCT|1|155|0.00645
-chr164967169149671691CTexonicZNF423nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102,UCEC|1|248|0.00403
rs773947241chr164967014549670145GAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184,PRAD|1|499|0.00200
-chr164966990549669905GCexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164966961349669613GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967228249672282C-exonicZNF423frameshift LUAD|4|543|0.00737
-chr164967151949671519TCexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs867011137chr164967249249672492CTexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967017449670174GCexonicZNF423nonsynonymous CESC|1|194|0.00515
rs776280246chr164967183049671830GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
rs201174934chr164967120749671207CTexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967275349672753CGexonicZNF423nonsynonymous LUAD|2|543|0.00368
-chr164967020549670205CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967194649671946CTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967084449670844GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204,KIPAN|1|799|0.00125,KIRC|1|451|0.00222
rs3803665chr164967252049672520AGexonicZNF423synonymous ACC|1|90|0.01111
rs372206769chr164967186349671863GAexonicZNF423synonymous BLCA|2|396|0.00505,COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967120149671201GAexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967042049670420CAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967104549671045GAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
rs144950533chr164967115249671152GAexonicZNF423synonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820
-chr164967128349671283CAexonicZNF423nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102
-chr164967258549672585GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967148549671485GAexonicZNF423synonymous SKCM|3|368|0.00815
-chr164967270249672702CAexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967061049670610GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
rs202013818chr164966977149669771GAexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
rs753674596chr164955931249559312CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967146749671467GCexonicZNF423synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967053149670531CTexonicZNF423synonymous SKCM|2|368|0.00543
-chr164967215149672151GAexonicZNF423synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967154849671548GTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs776173484chr164966987649669876GAexonicZNF423nonsynonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr164967025349670253CTexonicZNF423nonsynonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820
-chr164967204449672044CAexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164966966449669664TGexonicZNF423nonsynonymous ESCA|2|185|0.01081
rs749408750chr164966994949669949AGexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967087649670876GCexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164966988049669880CTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967244449672444CTexonicZNF423nonsynonymous DLBC|1|48|0.02083
-chr164967074449670744GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967036449670364ATexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs138148545chr164976473149764731GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967239549672395TCexonicZNF423nonsynonymous STAD|2|395|0.00506,STES|2|395|0.00506
-chr164967073449670734GTexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
rs201499268chr164967226849672268GAexonicZNF423synonymous UCEC|1|248|0.00403
rs761674679chr164967197349671973CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967252249672522GAexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967066349670663GCexonicZNF423nonsynonymous SARC|1|247|0.00405
-chr164955760349557603CTexonicZNF423nonsynonymous ESCA|1|185|0.00541,PAAD|1|185|0.00541
rs762582497chr164967002249670022CTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs779555962chr164967108549671085GAexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967095149670951CAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967127849671278GTexonicZNF423nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
rs370201380chr164967194749671947GAexonicZNF423synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967027949670279GTexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967084949670849GAexonicZNF423synonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967216049672160AGexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967060249670602GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164976479149764791CGexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967193749671937C-exonicZNF423frameshift STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs760413373chr164971317849713178CTintronicZNF423unknown CESC|1|194|0.00515
rs778755872chr164966976549669765CTexonicZNF423nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr164976485649764856CGexonicZNF423nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102
-chr164967076549670765CGexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164967179549671795GAexonicZNF423nonsynonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr164967052949670529AGexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs571689478chr164967032449670324CTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967126149671261GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164982345249823452CAexonicZNF423stopgain LUAD|1|543|0.00184
-chr164967103149671031GAexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164955759449557594CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164966967049669670ATexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967048449670484CTexonicZNF423nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr164955755349557553GTexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164966991349669913TAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
rs750249389chr164967156249671562CTexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195,UCEC|1|248|0.00403
-chr164966960849669608CAexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967130049671301TG-exonicZNF423frameshift BLCA|1|396|0.00253
-chr164967183049671830GTexonicZNF423stopgain UCEC|1|248|0.00403
-chr164967007149670071GAexonicZNF423stopgain BLCA|1|396|0.00253
-chr164967125049671250GTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs746399268chr164967268249672682GAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184,SKCM|1|368|0.00272
-chr164967165549671655GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967066949670669GAexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967135649671356GAexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967216849672168GCexonicZNF423nonsynonymous CESC|1|194|0.00515
rs757406757chr164967186249671862CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967040349670403CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164966975349669753CTexonicZNF423nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102
-chr164967188849671888CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs748113449chr164967062549670625CTexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967154749671547GCexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
rs764527468chr164967214849672148GAexonicZNF423synonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967248849672488TCexonicZNF423nonsynonymous GBMLGG|1|820|0.00122,LGG|1|530|0.00189
-chr164967237749672377CTexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967075849670758CTexonicZNF423nonsynonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr164967256049672560CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164982344149823441GTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs778618400chr164967209949672099TCexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967196549671965GAexonicZNF423synonymous SKCM|2|368|0.00543
rs377569533chr164967210949672109GAexonicZNF423synonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr164967133449671334TAexonicZNF423nonsynonymous LIHC|1|373|0.00268
rs371181840chr164967270649672706GAexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs146233664chr164976469449764694GAexonicZNF423nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
rs199542804chr164966970249669702GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967124349671243GTexonicZNF423stopgain LUAD|1|543|0.00184
-chr164966977049669770CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs373906393chr164966984349669843GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164976473349764733ACexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967210449672104TCexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164966976549669765CGexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164982340849823408CTexonicZNF423synonymous SKCM|2|368|0.00543
-chr164967212049672120GTexonicZNF423nonsynonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr164967060349670603GAexonicZNF423synonymous SKCM|2|368|0.00543
rs772823132chr164967181449671814GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967205249672052ATexonicZNF423synonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRC|1|451|0.00222
-chr164966970249669702GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164976479849764798CTexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164957732049577354CCCACCCATCGACTGGCCTAATCTGAGGCTCAATT-intronicZNF423unknown -
-chr164966992349669923G-exonicZNF423frameshift LUAD|3|543|0.00552
rs751260245chr164967243349672433CAexonicZNF423nonsynonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820
-chr164967241849672418GTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs750497057chr164966991149669911GAexonicZNF423nonsynonymous ESCA|1|185|0.00541
-chr164967213049672130GTexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967018549670185TCexonicZNF423nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
-chr164967046649670466GTexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967022549670225CTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967141149671411GTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967245149672451GTexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
rs145272522chr164967108149671081TGexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204,STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164955935349559353CAexonicZNF423synonymous LUAD|4|543|0.00737
-chr164955764649557646GAexonicZNF423synonymous SKCM|2|368|0.00543
-chr164967065249670652CTexonicZNF423nonsynonymous ESCA|2|185|0.01081
-chr164966008149660081CAexonicZNF423stopgain LIHC|1|373|0.00268
-chr164966012749660127GCexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967143249671432C-exonicZNF423frameshift BRCA|1|982|0.00102
rs748728165chr164967191149671911CTexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967171749671717GAexonicZNF423nonsynonymous ESCA|1|185|0.00541
-chr164967105649671056CTexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967219749672197ACexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
rs745433383chr164967099749670997GAexonicZNF423nonsynonymous STAD|2|395|0.00506,STES|2|395|0.00506
rs148732968chr164967097149670971CTexonicZNF423nonsynonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820,STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967269449672695AC-exonicZNF423frameshift KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
-chr164967092049670920GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967236149672361GAexonicZNF423synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164966961149669611CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967070649670706CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967087549670875CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272,UCEC|1|248|0.00403
-chr164967025449670254GTexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
rs766652392chr164966969149669691CTexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967015349670153CTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs368847069chr164967187149671871GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204,STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs138661785chr164967159249671592CTexonicZNF423nonsynonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820
-chr164967202049672020GAexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164966998849669988GTexonicZNF423stopgain LUAD|1|543|0.00184
rs777932033chr164967176449671764GAexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs760242467chr164967181949671819GAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164976471549764715GAexonicZNF423synonymous OV|1|469|0.00213
-chr164952520749525207CTexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967167049671670TCexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
rs747790367chr164967120349671203GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967058149670581CTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184,SKCM|1|368|0.00272
-chr164966015749660157TAexonicZNF423synonymous BRCA|1|982|0.00102
-chr164967215749672157CAexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164966979949669799GTexonicZNF423synonymous ESCA|1|185|0.00541
-chr164967123149671231TAexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967095449670954CAexonicZNF423synonymous TGCT|1|155|0.00645
-chr164967163049671630GCexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967276349672763GAexonicZNF423synonymous HNSC|1|512|0.00195
rs764927116chr164967078549670785GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
rs748651721chr164966986549669865GAexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967266749672667CAexonicZNF423synonymous LUAD|2|543|0.00368
-chr164967265449672654GAexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967114049671140GCexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967122849671228AGexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164966996749669967CAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967038949670389CGexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967078049670780CAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164976473249764732ACexonicZNF423nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102
rs370346450chr164967168649671686GAexonicZNF423synonymous CESC|1|194|0.00515
rs760436403chr164955930449559304CTexonicZNF423nonsynonymous GBMLGG|1|820|0.00122,LGG|1|530|0.00189,LIHC|1|373|0.00268
-chr164967237049672370GAexonicZNF423synonymous BLCA|1|396|0.00253,LUAD|2|543|0.00368
-chr164955928649559286CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs771703239chr164967016349670163CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967119949671199CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs749382074chr164967146349671463CTexonicZNF423nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102,UCEC|1|248|0.00403
rs145829157chr164966996749669967CTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967043049670430TCexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs368885869chr164967078449670784CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967243649672436GCexonicZNF423synonymous LUAD|3|543|0.00552
-chr164967202949672029TCexonicZNF423nonsynonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr164967179149671791CTexonicZNF423synonymous UCEC|1|248|0.00403
rs142344079chr164967141049671410CTexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967220449672204GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164966958449669584GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967034249670342CAexonicZNF423synonymous LUAD|2|543|0.00368
-chr164967088549670885CAexonicZNF423nonsynonymous TGCT|1|155|0.00645
rs772307020chr164976481749764817CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs780174138chr164967145549671455GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
rs376719006chr164955935349559353CTexonicZNF423synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967080549670805GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967164649671646GCexonicZNF423nonsynonymous GBM|1|290|0.00345,GBMLGG|1|820|0.00122
-chr164966976449669764GCexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
rs745876102chr164967225849672258CTexonicZNF423nonsynonymous UVM|1|80|0.01250
rs757246232chr164967081249670812GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967124049671240GTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164955934349559343GTexonicZNF423nonsynonymous COADREAD|1|489|0.00204,LUAD|1|543|0.00184,READ|1|122|0.00820
-chr164967152449671524ATexonicZNF423synonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr164967129749671297TCexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967138349671383CTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967181949671819GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|2|543|0.00368
-chr164967016449670164GTexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
rs13336762chr164967151849671518AGexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164966977449669774CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967197949671979CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164976471649764716GCexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967112649671126CAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
rs369619436chr164967119349671193CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs777639594chr164967041849670418GAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|2|543|0.00368
-chr164967157249671572CTexonicZNF423synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs776265059chr164985658149856581CTexonicZNF423nonsynonymous ESCA|1|185|0.00541
rs776964253chr164967159649671596GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967216149672161GTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967244149672441GTexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967080249670802GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164966014749660147TCexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967129949671299GTexonicZNF423nonsynonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr164967263949672639AGexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967199549671995ACexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967237849672378GAexonicZNF423nonsynonymous HNSC|2|512|0.00391
rs151294188chr164967119449671194GAexonicZNF423synonymous KICH|1|66|0.01515,KIPAN|1|799|0.00125
rs778205999chr164967009149670091CTexonicZNF423nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr164976473049764730CTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164976479449764794AGexonicZNF423synonymous HNSC|1|512|0.00195
rs776280102chr164976469249764692GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967125249671252CTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967176249671762GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs200218868chr164967108449671084CTexonicZNF423nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr164967034049670340-CexonicZNF423frameshift LUAD|1|543|0.00184
-chr164967041249670412GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967089449670894GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164966012449660124CAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967242949672429GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164971320349713203CTintronicZNF423unknown CESC|1|194|0.00515
-chr164966969549669695GAexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967043149670431CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967186549671865CTexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
rs566780634chr164976483649764836CTexonicZNF423synonymous HNSC|1|512|0.00195,STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967063549670635TCexonicZNF423nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRC|1|451|0.00222
rs117592972chr164966990749669907CTexonicZNF423synonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr164967223449672234CTexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562,SKCM|1|368|0.00272
-chr164982341049823410CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967168549671685CAexonicZNF423nonsynonymous CESC|1|194|0.00515
-chr164967190549671905GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967077749670777CTexonicZNF423synonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRC|1|451|0.00222
-chr164967204949672049GTexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164976484249764842GAexonicZNF423synonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr164955763749557637GTexonicZNF423synonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164967269249672695TCAC-exonicZNF423frameshift KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
rs116537749chr164982341149823411GAexonicZNF423synonymous OV|1|469|0.00213
-chr164967079249670792CAexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
-chr164955933149559331TCexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
rs200710667chr164976471149764711GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs144284315chr164967095549670955GAexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967020449670204CAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967006349670063CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs199688997chr164955758249557582CTexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164955760949557609CAexonicZNF423nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRC|1|451|0.00222
rs200411543chr164966976049669760GAexonicZNF423synonymous BRCA|1|982|0.00102,STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967172449671724GTexonicZNF423nonsynonymous LUSC|1|178|0.00562
rs763435948chr164967214749672147CTexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164966998249669982CGexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164955764949557649GTexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
rs767082011chr164967069749670697GTexonicZNF423nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr164967151749671517CTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs778240903chr164967252149672521CTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164966998049669980GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs775209030chr164967241849672418GAexonicZNF423synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967171149671711GTexonicZNF423nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr164967173449671734ATexonicZNF423stopgain HNSC|1|512|0.00195
rs139517505chr164976485749764857GAexonicZNF423synonymous STAD|2|395|0.00506,STES|2|395|0.00506
rs376572236chr164967276649672766TCexonicZNF423synonymous BRCA|1|982|0.00102
-chr164967222249672222GTexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr164967116649671166GAexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967220349672203GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164967186949671869CAexonicZNF423synonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164966962749669627GTexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164966961149669611CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164966997049669970GAexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967139949671399GAexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs573032120chr164967139649671396GAexonicZNF423nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr164967154149671541CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs532940886chr164966960249669602CTexonicZNF423nonsynonymous UVM|1|80|0.01250
-chr164976483849764838CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr164955754549557545GCexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967084049670840CTexonicZNF423synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967000749670007CAexonicZNF423nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
rs377503772chr164982343049823430GAexonicZNF423nonsynonymous CHOL|1|35|0.02857
rs750884387chr164967140949671409CTexonicZNF423nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr164967103349671033AGexonicZNF423nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr164967020349670203CAexonicZNF423nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs544721667chr164967034449670344GAexonicZNF423nonsynonymous DLBC|1|48|0.02083

Disease information of ZNF423
TF_name Disease_name Disease_class Disease_semantic_type TF_disease_source
ZNF423 Amphetamine-Related Disorders C25;F03 Mental or Behavioral Dysfunction CTD_human
ZNF423 Amphetamine Addiction C25;F03 Mental or Behavioral Dysfunction CTD_human
ZNF423 Amphetamine Abuse C25;F03 Mental or Behavioral Dysfunction CTD_human
ZNF423 Cystic Kidney Diseases C12;C13 Disease or Syndrome GENOMICS_ENGLAND
ZNF423 Arima syndrome C10;C11;C12;C13;C16 Disease or Syndrome ORPHANET
ZNF423 NEPHRONOPHTHISIS 14 Disease or Syndrome CTD_human;UNIPROT
ZNF423 JOUBERT SYNDROME 19 Disease or Syndrome CTD_human;UNIPROT
ZNF423 Ciliopathies C16 Congenital Abnormality GENOMICS_ENGLAND

Pathway associated with ZNF423
pathway_ID pathway_name pathway_source gene_number edge_number
pathway0000323 BMP2 signaling pathway(through Smad) ( TGF-beta_BMP Diagram(MolecularVariation) ) inoh 13 47
pathway0002755 Hs_White_fat_cell_differentiation_WP3946_90940 wikipathways 30 59

Go term information of ZNF423
GO_term_name GO_term_type TF_name
GO_NEGATIVE_REGULATION_OF_NITROGEN_COMPOUND_METABOLIC_PROCESS BP ZNF423
GO_POSITIVE_REGULATION_OF_BMP_SIGNALING_PATHWAY BP ZNF423
GO_REGULATION_OF_TRANSMEMBRANE_RECEPTOR_PROTEIN_SERINE_THREONINE_KINASE_SIGNALING_PATHWAY BP ZNF423
GO_POSITIVE_REGULATION_OF_TRANSMEMBRANE_RECEPTOR_PROTEIN_SERINE_THREONINE_KINASE_SIGNALING_PATHWAY BP ZNF423

Survival analysis of ZNF423



Calculate the hazards ratio based on Cox PH Model.
Add the 95% CI as dotted line.

Expression of ZNF423