TF information

TF name: ZNF628
TF family: zf-C2H2
Ensembl gene ID: ENSG00000197483
Ensembl protein ID: ENSP00000469591, ENSP00000465905, ENSP00000375598
Entrez gene ID: 89887
Database name Link Database name Link
NCBI Gene: Genecards:
Uniprot: Wikipedia:
Cosmic 3D: Geneontology:
CCLE:

Frequency of ZNF628 in all biosamples
Sample ID Biosample type Tissue type Biosample name TF Frequency
Sample_02_268Cell lineKidneyA-4980.0059073287797674
Sample_02_356Cell lineColonSw4800.18709677419355

ZNF628 distribution in samples’ most representative CRC
Sample ID Tissue type Biosample type Biosample name

ZNF628 distribution in all CRCs
Biosample type
Biosample name
Sample ID

Genomic distribution of SEs associated with ZNF628
Download

Mutation of ZNF628
Database name Link
gnomAD: gnomAD
ExAC: ExAC
ICGC:
Database name Link
Cosmic:
Cosmic cell lines:
Depmap:

TCGA somatic mutations and clinical variants of ZNF628

rsID Chr Start Stop Ref Alt Gene_region Gene_symble Effect TCGA_Occurrence
rs780328005chr195599503155995031GAexonicZNF628nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599484555994845GAexonicZNF628nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr195599547655995476GTexonicZNF628nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
rs34864744chr195599326055993260AGexonicZNF628nonsynonymous ACC|9|90|0.10000
-chr195599561655995616CTexonicZNF628nonsynonymous TGCT|1|155|0.00645
-chr195599500955995009GTexonicZNF628nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr195599295855992958C-exonicZNF628frameshift KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
rs780886909chr195599407455994074CTexonicZNF628nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs747339144chr195599430555994305GAexonicZNF628nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr195599559755995597GAexonicZNF628nonsynonymous KICH|1|66|0.01515,KIPAN|1|799|0.00125
-chr195599311755993117CTexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs12981044chr195599424055994240CTexonicZNF628synonymous KICH|1|66|0.01515,KIPAN|1|799|0.00125
-chr195599398555993985CGexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599489755994897-GexonicZNF628frameshift STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599486055994860CTexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599454355994543-CexonicZNF628frameshift COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr195599479855994798CTexonicZNF628synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr195599281155992811GAexonicZNF628nonsynonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820
-chr195599306455993064CTexonicZNF628synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599536555995365CTexonicZNF628synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599315655993156CTexonicZNF628nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599266855992668CTexonicZNF628synonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr195599516155995161CTexonicZNF628synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr195599419655994196GTexonicZNF628nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs761089331chr195599418055994180CTexonicZNF628synonymous BLCA|2|396|0.00505
rs114065657chr195599497555994975GTexonicZNF628synonymous DLBC|1|48|0.02083
rs780521871chr195599326455993264CTexonicZNF628nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
-chr195599444255994442GAexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599410555994105CTexonicZNF628synonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599270855992708CTexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599532155995321GTexonicZNF628nonsynonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr195599515255995152GAexonicZNF628synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs759924406chr195599299655992996CTexonicZNF628nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599443855994438CAexonicZNF628synonymous CESC|1|194|0.00515
rs764675252chr195599393755993937CTexonicZNF628synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs551631262chr195599411755994117CTexonicZNF628synonymous SARC|1|247|0.00405
rs372959006chr195599418855994188GAexonicZNF628nonsynonymous GBMLGG|1|820|0.00122,LGG|1|530|0.00189
rs745632371chr195599260155992601CTexonicZNF628nonsynonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr195599492855994928GTexonicZNF628nonsynonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr195599512255995122CAexonicZNF628synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599303155993031CTexonicZNF628synonymous SKCM|1|368|0.00272
-chr195599433455994334CTexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599499955994999GAexonicZNF628synonymous GBMLGG|1|820|0.00122,LGG|1|530|0.00189
-chr195599515155995151CTexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599295955992959CTexonicZNF628synonymous GBMLGG|1|820|0.00122,LGG|1|530|0.00189
-chr195599531155995311TCexonicZNF628synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs756567133chr195599543255995432CAexonicZNF628nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs750801178chr195599540755995407CTexonicZNF628synonymous BRCA|1|982|0.00102
rs147110934chr195599343655993436GTexonicZNF628nonsynonymous ACC|1|90|0.01111
rs146432627chr195599282455992824CTexonicZNF628synonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
rs749006014chr195599526555995265CAexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs369974817chr195599302155993021CGexonicZNF628nonsynonymous ACC|1|90|0.01111
-chr195599513955995139ACexonicZNF628nonsynonymous LIHC|1|373|0.00268
-chr195599309655993096GCexonicZNF628nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599303155993031CGexonicZNF628nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs151142470chr195599511855995118CTexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs773054424chr195599442755994427ACexonicZNF628nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102,KIPAN|1|799|0.00125,KIRC|1|451|0.00222
-chr195599492055994920CTexonicZNF628nonsynonymous CHOL|1|35|0.02857
-chr195599410955994109CAexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs867015713chr195599259855992598CTexonicZNF628nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204,PAAD|1|185|0.00541
-chr195599319055993190CTexonicZNF628synonymous LUAD|4|543|0.00737
-chr195599505155995051AGexonicZNF628nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr195599527155995271CTexonicZNF628nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
-chr195599289655992896CTexonicZNF628synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr195599286855992868GAexonicZNF628nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599395955993959TCexonicZNF628nonsynonymous SARC|1|247|0.00405
-chr195599275755992757GTexonicZNF628nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
-chr195599482755994827GAexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599543955995439GTexonicZNF628nonsynonymous TGCT|1|155|0.00645
-chr195599438555994385CAexonicZNF628nonsynonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599453655994536GAexonicZNF628nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599262955992629GTexonicZNF628nonsynonymous ESCA|1|185|0.00541
-chr195599296155992961A-exonicZNF628frameshift KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
-chr195599496755994967CTexonicZNF628stopgain UCEC|1|248|0.00403
-chr195599301955993019C-exonicZNF628frameshift SKCM|1|368|0.00272
-chr195599493155994931GCexonicZNF628nonsynonymous ESCA|1|185|0.00541
-chr195599423155994231CTexonicZNF628synonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599433555994335GAexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs373922538chr195599507055995070CTexonicZNF628nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
rs759599920chr195599536655995366GAexonicZNF628nonsynonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr195599529755995297GAexonicZNF628nonsynonymous BRCA|1|982|0.00102,STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599290855992908CTexonicZNF628synonymous SKCM|1|368|0.00272
rs771060228chr195599449255994492CTexonicZNF628synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599476255994762GAexonicZNF628synonymous COADREAD|1|489|0.00204,READ|1|122|0.00820
-chr195599511955995119GAexonicZNF628synonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599323555993235GAexonicZNF628synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599514755995147ATexonicZNF628nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184
rs762367964chr195599265955992659GAexonicZNF628synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599521355995213GCexonicZNF628nonsynonymous CESC|1|194|0.00515
rs372270431chr195599534755995347GAexonicZNF628synonymous UCEC|1|248|0.00403
-chr195599430255994302TCexonicZNF628nonsynonymous TGCT|1|155|0.00645
-chr195599408555994085GAexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
rs751531003chr195599421055994210GAexonicZNF628synonymous PRAD|1|499|0.00200
-chr195599302155993021CAexonicZNF628nonsynonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599512555995125GAexonicZNF628synonymous PAAD|1|185|0.00541
-chr195599290955992909CTexonicZNF628synonymous SKCM|1|368|0.00272
rs747118126chr195599318455993184CTexonicZNF628synonymous UVM|1|80|0.01250
-chr195599434255994342CAexonicZNF628nonsynonymous HNSC|1|512|0.00195
rs747362459chr195599515855995158GAexonicZNF628synonymous ACC|1|90|0.01111
rs752028788chr195599393855993938GTexonicZNF628nonsynonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599296155992961ATexonicZNF628nonsynonymous KIPAN|1|799|0.00125,KIRP|1|282|0.00355
-chr195599361955993619GTexonicZNF628synonymous BLCA|1|396|0.00253
-chr195599517055995170GAexonicZNF628synonymous HNSC|2|512|0.00391
-chr195599304255993042C-exonicZNF628frameshift KIPAN|4|799|0.00501,KIRC|4|451|0.00887
-chr195599532255995322ATexonicZNF628nonsynonymous COAD|1|367|0.00272,COADREAD|1|489|0.00204
-chr195599425855994258CGexonicZNF628nonsynonymous BLCA|1|396|0.00253
rs778452703chr195599446255994462CTexonicZNF628synonymous STAD|1|395|0.00253,STES|1|395|0.00253
-chr195599303355993033AGexonicZNF628nonsynonymous LUAD|1|543|0.00184

Disease information of ZNF628
TF_name Disease_name Disease_class Disease_semantic_type TF_disease_source

Pathway associated with ZNF628
pathway_ID pathway_name pathway_source gene_number edge_number

Go term information of ZNF628
GO_term_name GO_term_type TF_name

Survival analysis of ZNF628



Calculate the hazards ratio based on Cox PH Model.
Add the 95% CI as dotted line.

Expression of ZNF628