CR overview
| CR: | HCFC1 | |
| Accession: | P51610 | |
| Protein names: | HCFC1 protein | |
| Function type: | Histone Modifier,Chromatin Remodeler | |
| Histone type: | Reader | |
| Methytor type: | Unkown | |
| Aliases: | NSL, COMPASS, MLL-HCF, CHD8, MLL2/3, COMPASS-like MLL1,2, MLL4/WBP7;host cell factor family | |
| PMID: | 35013307 23000143 23539139 | |
| Disease: | 7 | |
| Go term: | 36 | |
| Pathway: | 2 | |
| Hallmark: | 1 | |
| Super Enhancer: | chrX:153267161-153285318 chrX:153267067-153281444 chrX:153231541-153240605 chrX:153234479-153239181 chrX:153233348-153238065 chrX:153231138-153240366 chrX:153235301-153239211 chrX:153231215-153240604 chrX:153231916-153240583 chrX:153232041-153240854 chrX:153231505-153240763 chrX:153230653-153240803 chrX:153231331-153240904 chrX:153231854-153240534 chrX:153230831-153239333 chrX:153233727-153239712 chrX:153232117-153240862 chrX:153225164-153240607 chrX:153231679-153240750 chrX:153231647-153239205 chrX:153231627-153239996 chrX:153231485-153239855 chrX:153235250-153239289 chrX:153234325-153240250 chrX:153234151-153239695 chrX:153233519-153240611 chrX:153230207-153240849 chrX:153234436-153239571 chrX:153233850-153239453 chrX:153229990-153241018 chrX:153230134-153241246 chrX:153234658-153239153 chrX:153231671-153240477 chrX:153228845-153240559 chrX:153232463-153240904 chrX:153232561-153241653 chrX:153233416-153241160 chrX:153233535-153240558 chrX:153233977-153240261 chrX:153231205-153240151 chrX:153234102-153240305 chrX:153231205-153240151 chrX:153232668-153239779 chrX:153234174-153240391 chrX:153234570-153239539 chrX:153232661-153240181 chrX:153231680-153240623 chrX:153233253-153240207 chrX:153233043-153240403 |
|
| Enhancer: |
chrX:153031040-153031610 chrX:153031780-153032320 chrX:153277370-153277970 chrX:153278130-153278490 chrX:153199930-153200330 chrX:153284530-153284640 chrX:153198030-153199390 chrX:153199460-153199820 chrX:153218410-153219050 chrX:153278880-153279490 chrX:153209610-153209760 chrX:153209870-153210030 chrX:153579410-153579940 chrX:153580060-153580250 chrX:153174620-153174890 chrX:153186610-153186810 chrX:153186980-153187050 chrX:153081900-153083390 chrX:153138150-153138680 chrX:153140500-153141210 chrX:153283570-153283740 chrX:153283810-153284040 chrX:153284240-153284420 chrX:153284780-153284880 chrX:153285050-153285120 chrX:153029760-153030920 chrX:153219220-153219510 chrX:153282520-153283450 chrX:153762710-153763380 chrX:153266310-153268770 chrX:153272380-153274580 chrX:153361460-153363060 chrX:153268920-153270280 chrX:153207480-153207740 chrX:153225870-153226990 chrX:152955060-152955820 chrX:152955960-152956750 chrX:153279730-153281480 chrX:153281550-153281880 chrX:153577400-153577720 chrX:153608160-153608300 chrX:153608380-153608590 chrX:153608730-153609110 chrX:153176640-153178150 chrX:153311110-153313600 chrX:153595220-153595760 chrX:153304890-153306670 chrX:153306850-153308010 chrX:153308510-153309140 chrX:153310250-153310920 chrX:153535420-153537690 chrX:153553770-153555930 chrX:152892460-152893450 chrX:153186260-153186540 chrX:152862440-152864410 chrX:152751170-152751920 chrX:152752120-152752600 chrX:152752610-152754920 chrX:152786060-152786980 chrX:152957010-152957420 chrX:152957560-152958490 chrX:152958630-152958710 chrX:152958820-152958910 chrX:152959040-152959350 chrX:152959720-152959790 chrX:152959900-152959980 chrX:152960340-152960520 chrX:152963520-152965940 chrX:152966430-152967460 chrX:152967560-152968380 chrX:153008800-153008940 chrX:153046600-153046670 chrX:153046800-153046950 chrX:153047070-153047190 chrX:153047290-153047570 chrX:153264620-153266010 chrX:153388430-153390880 chrX:153577930-153578010 chrX:153578240-153578390 chrX:153578800-153579270 chrX:153580390-153580540 chrX:153581570-153581660 chrX:153587520-153587610 chrX:153592530-153592620 chrX:153594590-153594670 chrX:153594840-153594920 chrX:153595010-153595090 chrX:153595910-153596000 chrX:153596110-153596200 chrX:153609160-153609240 chrX:153628970-153629040 chrX:153631180-153631280 chrX:153665650-153666860 chrX:153672690-153673670 chrX:153686770-153688490 chrX:153706400-153706620 chrX:153706750-153707060 chrX:153713990-153714100 chrX:153714320-153714560 chrX:153742140-153744080 chrX:153762380-153762550 chrX:153764260-153764350 chrX:153764390-153765460 chrX:153823850-153825690 chrX:153831670-153833120 chrX:153835720-153836080 chrX:152599740-152602090 chrX:153189420-153191580 chrX:153386930-153388190 chrX:153583440-153585080 chrX:153714670-153714870 chrX:153763600-153764150 chrX:153827980-153830400 chrX:153733520-153734480 chrX:153121950-153122700 chrX:153206620-153206930 chrX:153215230-153215520 chrX:153275300-153275950 chrX:152888140-152889370 chrX:153033370-153033660 chrX:153208530-153208990 chrX:153209170-153209340 chrX:153356850-153357640 chrX:153359370-153361130 chrX:153207110-153207400 chrX:153298710-153299520 chrX:153339100-153340730 chrX:153357770-153358900 chrX:152821880-152822370 chrX:152825400-152826130 chrX:152858190-152860000 chrX:153047660-153048220 chrX:153048330-153048400 chrX:153048570-153048680 chrX:153048700-153049200 chrX:153049340-153049420 chrX:153070360-153070550 chrX:153070660-153070950 chrX:153645430-153647880 chrX:153197880-153197990 chrX:153033880-153034400 chrX:153196720-153196880 chrX:153205690-153205830 chrX:153205910-153206340 chrX:153589940-153590030 chrX:153590160-153590340 chrX:153590520-153590600 chrX:153590950-153591020 chrX:153591150-153592380 chrX:153592740-153592890 chrX:153593090-153593180 chrX:153593330-153593500 chrX:153593630-153593710 chrX:153593860-153594390 chrX:152862040-152862370 chrX:152996090-152997200 |
|
| Promoter: |
chrX:153969818-153973818 |
ChIP-seq based regulatory details of HCFC1
| Sample ID | CR | Biosample type | Biosample term name | File accession | Experiment accession | Source |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CR_01_0173 | HCFC1 | cell line | HeLa-S3 | ENCFF000XEV | ENCSR000ECH | Encode |
| CR_01_0252 | HCFC1 | cell line | GM12878 | ENCFF002EAN | ENCSR514VAY | Encode |
| CR_01_0253 | HCFC1 | cell line | GM12878 | ENCFF002EAO | ENCSR514VAY | Encode |
| CR_01_0256 | HCFC1 | cell line | HepG2 | ENCFF002EDN | ENCSR529JYA | Encode |
| CR_01_0257 | HCFC1 | cell line | HepG2 | ENCFF002EDS | ENCSR529JYA | Encode |
| CR_01_0408 | HCFC1 | cell line | MCF-7 | ENCFF373VCW | ENCSR697CUP | Encode |
| CR_01_0612 | HCFC1 | cell line | MCF-7 | ENCFF884TDT | ENCSR697CUP | Encode |
| CR_01_0797 | HCFC1 | cell line | K562 | ENCFF000YOE | ENCSR000EFN | Encode |
| CR_01_0798 | HCFC1 | cell line | K562 | ENCFF000YOG | ENCSR000EFN | Encode |
| CR_02_0397 | HCFC1 | cell line | K562 | SRR5111693 | GSE91831 | GEO |
| CR_02_0398 | HCFC1 | cell line | GM12878 | SRR5111694 | GSE91831 | GEO |
| CR_02_0399 | HCFC1 | cell line | K562 | SRR5111726 | GSE91846 | GEO |
| CR_02_0435 | HCFC1 | cell line | K562 | SRR5111727 | GSE91846 | GEO |
| CR_02_0490 | HCFC1 | cell line | HeLa | SRR332357 | GSE31417 | GEO |
Downstream target genes of HCFC1
Upstream regulatory details of HCFC1
Protein-protein interaction of HCFC1
Annotation of HCFC1
TCGA cancer survival map of HCFC1
Other information of HCFC1